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05 Déc 11 NLM récompense les meilleurs applications

La U.S National Library of Medicine (NLM) [1] a annoncé les gagnants d’un concours d’applications logicielles, à l’occasion d’une cérémonie organisée le 2 Novembre en présence d’Aneesh Chopra, directeur de la technologie (CTO) du gouvernement américain [2], et de Todd Park, Directeur de la technologie du ministère américain de la santé [3]. Le concours « Show Off Your Apps » [4] visait à distinguer les applications logicielles exploitant de manière innovante et créative sa vaste base de données publiques.

La NLM, qui fait partie des National Institutes of Health (NIH) [5], est la plus grande bibliothèque médicale du monde et se veut pionnière dans l’utilisation de la technologie pour l’amélioration de l’accès à l’information biomédicale et en santé. Le NLM met à disposition du public une grande variété d’information : essais cliniques, images historiques, séquences d’ADN, etc.

Pour faciliter l’accès à ces données, Le NHL propose de nombreux outils et interfaces de programmation [6].

5 applications gagnantes

GLAD4U [7] est une application web gratuite qui permet aux chercheurs de répondre à des questions telles que « Quels sont les gènes liés au cancer du sein? ». GLAD4U (Gene List Automatically Derived for You) automatise le processus de création de listes de gènes. Cette application s’appuie sur l’API « Entrez Programming Utilities » [8] du National Center for Biotechnology Information (NCBI) [9], un département de la NLM. GLAD4U a été développée par Jérôme Jourquin [10], Bing Zhang, et Dexter Duncan avec le soutien du département d’informatique biomédicale au Vanderbilt University Medical Center à Nashville dans le Tennessee.

iAnatomy [11] est un atlas d’anatomie disponible sur l’iPhone et l’iPod touch. L’application mobile permet aux utilisateurs d’apprendre l’anatomie de manière interactive avec la possibilité de zoomer sur les images pour plus de détails. iAnatomy exploite les données du projet « Visible Human » de la NLM [12]. iAnatomy a été développé par Anouk Stein, MD, un radiologue et programmeur informatique à Phoenix dans l’Arizona.

KNALIJ [13], que l’on prononce comme « knowledge » [14], aide les chercheurs, étudiants et consommateurs à visualiser de grandes quantités de données telles que les informations contenues dans la base de publications PubMed de la NLM. KNALIJ présente l’information sous la forme de visuels, de cartes interactives pouvant améliorer considérablement les capacités des chercheurs à analyser de grandes quantités d’information et de réduire considérablement leur temps d’exploration. KNALIJ été développé par Alan M. Finkel de la société iWakari à Los Angeles et son partenaire Steven Melnikoff, membre honoraire invité à l’Université de Melbourne, en Australie.

NLMplus [15] est une application de recherche sémantique et de découverte de savoir qui recherche simultanément 59 bases de données de la NLM pour permettre aux utilisateurs d’explorer le contenu offert par la NLM dans tous les domaines de la biomédecine et la santé. NLMplus a été développée par Weizhong Zhu, Ph.D. et Antonio Zamora, du WebLib LLC de Bethesda.

Quertle [16] est une application web innovante de recherche et d’investigation de la littérature biomédicale. Il s’adresse aux professionnels des sciences de la vie, y compris les chercheurs et les fournisseurs de soins de santé. Quertle recherche simultanément plusieurs sources de littérature des sciences du vivant, y compris la National Library of Medicine MEDLINE et TOXLINE. Ce projet a été dirigé par Jeff Saffer, Ph.D. et Vicki Burnett, Ph.D. de Boulder dans le Colorado.

5 applications avec mention honorable

La plateforme « BioDigital Human » [17] est une application web en 3D à destination des patients, étudiants, et cliniciens, qui vise à simplifier la compréhension de l’anatomie et des maladies du corps humain. L’application propose des outils pour explorer, disséquer et partager des vues personnalisées du corps humain, associés à des descriptions détaillées provenant du service MedlinePlus [18] de la NLM. La plateforme a été développée par BioDigital systems LLC à New York.

DailyMedPlus [19] fournit un accès en ligne aux informations pharmaceutiques provenant de plusieurs bases de la NLM. Le site propose un moteur de recherche complet qui peut être utilisé par les patients et les professionnels de la santé. DailyMedPLus a été développé par une équipe de Medicos Consultants LLC, à Baltimore.

« Drug Diary » [20] est une application iPhone qui permet aux utilisateurs d’inventorier leurs prescriptions et les médicaments en vente libre et de conserver des notes sur leurs soins. L’application donne la possibilité de communiquer des rapports de soins aux prestataires de santé. L’application s’appuie sur les termes à la norme Rx [21] et les informations proposées par le service MedlinePlus.gov de la NLM. « Drug Diary » a été développée par Jeff Rames, fondateur de la société Foodlight Software LLC, à Chicago.

Molecules [22] est une application disponible sur iPhone, iPodTouch et iPad qui permet de visualiser des modelisation 3D de molécules. Cette application s’appuie sur l’API « Entrez » du NCBI [9] et la base de données PubChem [23]. Molecules a été développée par Brad Larson, directeur de Sunset Lake Software à Madison dans le Wisconsin.

ORKOV est une application pour iPhone [24] et Android [25] à destination des chercheurs du médical, qui permet d’effectuer des recherches dans la base PubMed.gov [26]. ORKOV a été développée par la société Visual Soft à Vienna, en Virginie.

 

 

– [1] Site Web de la U.S National Library of Medicine: http://www.nlm.nih.gov
– [2] Aneesh Chopra – CTO : http://redirectix.bulletins-electroniques.com/Yn2U1
– [3] Todd Park – Health and Human Services CTO :http://www.hhs.gov/open/discussion/todd_park_bio.html
– [5] Site web des National Institutes of Health: http://www.nih.gov
– [7] GLAD4U : http://bioinfo.vanderbilt.edu/glad4u/
– [8] Documentation de l’API « Entrez Programming Utilities » :http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25501/
– [9] National Center for Biotechnology Information : www.ncbi.nlm.nih.gov/
– [10] Jerome Jourquin : http://vanderbilt.academia.edu/JeromeJourquin
– [11] iAnatomy sur itunes :http://itunes.apple.com/us/app/ianatomy/id328875702?mt=8
– [12] Projet Visible Human de la U.S National Library of Medicine:http://www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html
– [13] Knalij : http://knalij.com/
– [14] « connaissance »
– [15] URL de l’application web NMPlus : http://nlmplus.com
– [16] URL de l’application web QUERTLE : http://quertle.info/
– [17] Plateforme Biodigital Human : http://www.biodigitalhuman.com/
– [18] Site http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/
– [19] Site de DailyMedPlus : www.dailymedplus.com
– [20] Drug Diary sur iTunes : http://itunes.apple.com/us/app/drug-diary/id399537600?mt=8
– [21] Norme Rx :http://www.nlm.nih.gov/research/umls/rxnorm/overview.html
– [22] Site Web de la application iPhone « Molecule » :http://www.sunsetlakesoftware.com/molecules
– [23] Site web du projet PuChem : http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
– [24] Orkov sur iPhone :http://itunes.apple.com/us/app/orkov/id336927484?mt=8
– [25] Orkov sur Android : https://market.android.com/details?id=com.orkov
– [26] Site de PubMed : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

 

Source :

 

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